Bioinformática de alto rendimiento en biología sintética: circuitos transcripcionales y metabólicos integrados.
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La bioinformática utiliza elementos de la biología molecular como {hardware} para implementar artilugios computacionales. Siguiendo directrices predefinidas, normalmente codificadas en programas orgánicos, estos artilugios son capaces de procesar entradas y devolver salidas, computando así datos. La clave del éxito de cualquier proyecto de bioinformática es disponer de una gran cantidad de instrumentos moleculares y motivos orgánicos a partir de los cuales se puedan ensamblar los artilugios necesarios.
La biología sintética es un excelente campo de juego para esta función, ya que proporciona bastantes elementos genéticos que permiten la ingeniería racional de circuitos genéticos que imitan los hábitos de las funciones digitales, equivalentes a las puertas lógicas. Un gran problema para la bioinformática es desarrollar el {hardware} molecular más allá del ámbito de los elementos genéticos, aprovechando el metabolismo del huésped. Este objetivo requiere la formalización de la interacción de las construcciones genéticas con el resto del equipo móvil.
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| PCR Mix | |||
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Además, el sector de la ingeniería metabólica ha tenido poca intersección con la bioinformática hasta este punto, lo que ha llevado a una escasez de definición de la dinámica metabólica como fundamento informático. En este artículo angular, abogamos por la conceptualización del metabolismo y sus motivos como el mejor camino a seguir para realizar biocomputaciones de células enteras. El diseño de circuitos transcripcionales y metabólicos fusionados no sólo mejorará la cantidad y el tipo de datos procesados por un conjunto artificial, sino que también puede presentar mecanismos de gestión elementales para una mayor fiabilidad.
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Las ciencias aplicadas de alto rendimiento para la adquisición de información orgánica están avanzando a un ritmo cada vez mayor. Más prominentemente, la reducción del precio de la secuenciación del ADN ha llevado a un progreso exponencial de datos de secuencia, junto con genomas humanos de personas particulares. Esta sesión del Simposio del Pacífico 2019 sobre Biocomputación presenta los desafíos distintivos de privacidad y morales asociados a la era, el almacenamiento, el procesamiento, el examen y el intercambio de información orgánica de las personas generada por una multitud de ciencias aplicadas junto con, pero no limitado a, la genómica, la proteómica, la metagenómica, la bioimagen, los biosensores y los rastreadores de bienestar privado.
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La misión es reunir a biólogos computacionales, biólogos experimentales, científicos de ordenadores portátiles, éticos y legisladores para compartir conceptos, centrarse en los retos asociados a la información orgánica y la privacidad.
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3DBIONOTES v3.0: cruce de información de biología molecular y estructural con variaciones genómicas.
Muchas enfermedades están relacionadas con polimorfismos de un solo nucleótido que repercuten en áreas vitales de las proteínas como sitios de unión o publican modificaciones traslacionales. Por lo tanto, analizar las variantes genómicas con información de biología estructural y molecular es un marco sólido para dilucidar las causas potenciales de tales enfermedades.
Se ofrece un modelo totalmente nuevo de nuestro marco de Internet 3DBIONOTES. Este modelo presenta nuevos instrumentos para analizar y visualizar las anotaciones de proteínas y variantes genómicas, junto con una evaluación de contingencia de las variantes y opciones de aminoácidos por medio de una comprobación real de Fisher, la mezcla de un visor de anotación de genes para centrarse en las opciones de proteínas en las secuencias de genes y un visor de interacción proteína-proteína para mostrar las anotaciones de proteínas en la etapa de la comunidad.
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Instituto Nacional de Bioinformática (INB ELIXIR-ES) y Unidad de Bioinformática, Centro Nacional de Biotecnología (CSIC)/Centro de Procesado de Imágenes, C/ Darwin nº 3, Campus de Cantoblanco, 28049 Madrid, España
Fuentes :
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