Quorum-Sensing Synchronization of Synthetic Toggle Switches: Un diseño basado en la teoría de sistemas dinámicos monótonos.

Las construcciones sintéticas de la biotecnología, la bioinformática y las intervenciones terapéuticas genéticas de moda a veces se basan principalmente en plásmidos o circuitos transfectados que implementan algún tipo de intercambio “on-off”. Por ejemplo, la expresión de una proteína utilizada para funciones terapéuticas es probable que se desencadene por la popularidad de una mezcla particular de inductores (por ejemplo, antígenos), y la reminiscencia de esta ocasión debe mantenerse a lo largo de un habitantes de las células hasta que un estímulo particular instrucciones de un cierre coordinado.

 

DiscoveryProbe? DNA Damage/DNA Repair Library
L1033-.1 ApexBio
DiscoveryProbe? DNA Damage/DNA Repair Library
L1033-.25 ApexBio
DiscoveryProbe? DNA Damage/DNA Repair Library
L1033-5 ApexBio
T7 DNA
310-005 GeneOn
T7 DNA
310-025 GeneOn

La solidez de un diseño de este tipo se ve obstaculizada por el ruido molecular (“intrínseco”) o ambiental (“extrínseco”), que puede dar lugar a ajustes espontáneos de estado en un subconjunto de los habitantes y se refleja en la bimodalidad de la expresión de proteínas, como se mide, por ejemplo, utilizando citometría de movimiento.
En este contexto, un circuito de corrección por “voto mayoritario”, que devuelva a las células desviadas al estado requerido, resulta muy fascinante, y la detección de quórum se ha planteado como un método para que las células transmitan sus estados al conjunto de los habitantes con el fin de facilitar el consenso.

Protein-Export Protein SecB (SecB) Protein
Abbexa
Protein G Protein
Abbexa
Protein G Protein
Abbexa

 

En este trabajo, sugerimos lo que consideramos es el primario tal diseño que ha matemáticamente asegurado propiedades de estabilidad y auto-corrección por debajo de situaciones seguras. Nuestro método se guía por ideas y conceptos del sector de los programas dinámicos “monótonos” desarrollados por M. Hirsch, H. Smith y otros. Comparamos nuestro diseño evaluándolo con un diseño actual que ha sido objeto de investigación experimental y teórica, ilustrando su superioridad en estabilidad y autocorrección de errores de sincronización.

Paraffin Wax Dispenser
Scientific Laboratory Supplies
Paraffin wax, granular (56 - 60)
Glentham Life Sciences
Paraffin wax, granular (56 - 60)
Glentham Life Sciences
Paraffin wax, granular (56 - 60)
Glentham Life Sciences
Paraffin wax, granular (56 - 60)
Glentham Life Sciences

Nuestra evaluación de la estabilidad, basada principalmente en el concepto de programas dinámicos, garantiza la convergencia internacional a estados regulares, descartando comportamientos impredecibles (“caóticos”) e incluso oscilaciones sostenidas dentro del límite de convergencia. Estos resultados son legítimos independientemente de los valores de los parámetros y se basan únicamente en el diagrama de cableado. El concepto se complementa con la evaluación computacional intensiva de bifurcación, llevada a cabo para un maniquí bioquímicamente detallado y biológicamente relevante que hemos desarrollado. Otra función novedosa de nuestro método es que nuestros teoremas sobre la estabilidad exponencial de estados regulares para poblaciones homogéneas o mezcladas son legítimos independientemente de la cantidad N de células dentro de la población, que normalmente es muy grande (N ≫ 1) y desconocida.

MULTIPLEX KIT PCR MASTITIS PCR kit
Bioingentech
MULTIPLEX KIT PCR MASTITIS PCR kit
Bioingentech
PCR Mix
Biochain
PCR-EZ D-PCR MASTER MIX
Bio Basic
MULTIPLEX KIT PCR Babesia & Theileria PCR kit
Bioingentech

Demostramos que la estabilidad exponencial depende únicamente de las proporciones relativas de cada tipo de estado. Mientras que el concepto de programas monótonos se ha utilizado de antemano para la evaluación de los programas de biología, el presente trabajo ilustra su energía para el diseño de la biología artificial, y por lo tanto tiene un significado más amplio correctamente más allá de la aplicación a la desventaja esencial de la coordinación de los interruptores de palanca.

 Quorum-Sensing Synchronization of Synthetic Toggle Switches: A Design Based on Monotone Dynamical Systems Theory.

Rat Cholesterol ELISA ELISA
E01A11128 BlueGene
Goat Cholesterol ELISA ELISA
E01A46041 BlueGene
Sheep Cholesterol ELISA ELISA
E01A98335 BlueGene
Mouse Cholesterol ELISA ELISA
E01A19869 BlueGene
Human Cholesterol ELISA ELISA
E01A2368 BlueGene

Integración y escisión del genoma por un nuevo bacteriófago de Streptomyces, ϕJoe.

Los bacteriófagos son la fuente de muchos instrumentos beneficiosos para la biología molecular y la manipulación genética. En Streptomyces, la mayoría de los vectores de clonación de ADN se basan principalmente en programas de recombinación de ADN específicos del sitio serina integrasa derivados de fagos. Debido a su eficacia y facilidad, las integrasas de serina se utilizan además para numerosos fines de biología artificial.

Aquí, actualizamos el genoma de un nuevo fago de Streptomyces, ϕJoe, y examinamos las situaciones de integración y escisión del genoma de ϕJoe. ϕJoe pertenece al mayor cluster de fagos de Streptomyces (R4-like) y codifica una integrasa de serina. El sitio web attB de Streptomyces venezuelae fue utilizado eficazmente por un plásmido integrador, pCMF92, construido utilizando el locus int-attP de ϕJoe. El sitio web attB para ϕJoe integrasa fue ocupado en un número de genomas Streptomyces, junto con la de S. coelicolor, por un componente celular que varía en el material de contenido de genes y la medición entre las especies huésped.

Rat Cholesterol ELISA ELISA
E01A11128 BlueGene
Goat Cholesterol ELISA ELISA
E01A46041 BlueGene

Las integrasas de serina requieren una cuestión de direccionalidad de recombinación codificada por fago (RDF) para activar la respuesta de escisión. El ϕJoe RDF fue reconocido, y su operar fue confirmado in vivo Tanto la integrasa y RDF han sido animados en ensayos de recombinación in vitro. Es muy probable que el sistema de recombinación sitio-específica ϕJoe se convierta en un complemento esencial de las herramientas de biología artificial e ingeniería genómica.

Fuentes :

  1. Gentaur
  2. NCBI
Pin Wrenches 1.5” Diameter, 1 Pair
0-120-0001 Biologics
Stepped Micro Tip (includes Interface Washers)
0-120-0005 Biologics
Tapered Micro Tips
0-120-0007 Biologics
Tapered Micro Tips 5 mm Diameter Tapered Titanium Micro Tip
0-120-0008 Biologics
10 mm Diameter Solid Titanium Tip
0-120-0009 Biologics

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